L’abbaye cistercienne de Pontigny date du XIIe siècle, mais il faut attendre le début du XVIIIe pour qu’elle accueille, sur une grande tribune sculptée, un seul positif. Vers 1773, un grand orgue du XVIIe siècle, provenant de Châlons-en-Champagne, est installé par le facteur Jean RICHARD (v. 1732-1815).
Cinquante ans plus tard, le curé du lieu vend une partie de la tuyauterie. L’instrument est remis en état en 1868 par l’abbé Piellard, puis en 1887 par le facteur d'orgue Paul Chazelle.
L’orgue est endommagé en 1943 par l’explosion d’un train de munitions en gare de Pontigny. Il est "restauré" entre 1957 et 1961 par R. Masset, des Établissements Gutschenritter. Faute d'entretient, il devient quasi muet dans les années 1990.
Depuis 2002, l’association « Orgue à Pontigny » contribue à la connaissance, la conservation et la restauration du grand orgue historique de la commune de Pontigny. Grâce à elle, la tuyauterie de l’instrument a été classée au titre des monuments historiques, et une importante rénovation a pu être entreprise, réactivée en 2015, pour aboutir enfin en 2023.
Jean Luc Benoît